Susceptibilidad antimicrobiana de Streptococcus agalactiae en un hospital materno-infantil de Lima, Perú. 2015-2020

Objetivo : Determinar la susceptibilidad antimicrobiana de cepas de Streptococcus agalactiae (EGB) aisladas entre 2015-2020 en un hospital materno-infantil. Material y métodos : Estudio descriptivo realizado entre 2015 y 2020. La identificación y susceptibilidad antimicrobiana se determinaron por el sistema automatizado Vitek® 2. La base de datos obtenida fue transferida al programa WHONET versión 5.6. Se incluyeron 506 aislamientos de EGB. Resultados : 500 (98,8%) fueron en mujeres. La edad media fue de 31,9 ± 11,8 años. Todos fueron sensibles a penicilina, ampicilina y vancomicina, la resistencia a eritromicina, clindamicina y levofloxacino fue de 38,5%, 37,4% y 28%, respectivamente, mostrando un pico de resistencia en 2018. Conclusión : Se observó un incremento en la resistencia de EGB a los antimicrobianos, especialmente el año 2018.

SUMMARY Objective : To determine the antimicrobial susceptibility of S. agalactiae (SA) strains isolated from 2015-2020 in a maternal-infant hospital in Lima, Peru. Methods : A descriptive study was carried-out from 2015 to 2020. Identification and susceptibility were performed using Vitek®2. Data base was transferred to the WHONET version 5.6 program; 506 isolates were analyzed. Results: 500 (98.8%) were females; mean age was 31.9 ± 11.8 years. All strains were susceptible to penicillin, ampicillin and vancomycin. Resistance to erythromycin, clindamycin and levofloxacin were 38.5%, 37.4% and 28%, respectively, showing the highest value in 2018. Conclusions : An increase in resistance of SA to antimicrobials was observed, especially in 2018.

Caracterización molecular de genes de virulencia (lmb, bca y rib) y de resistencia a macrólidos (ermB, ermTR y mefA) en aislamientos clínicos de Streptococcus agalactiae / Molecular characterization of virulence (lmb, bca and rib) and macrolid resistance genes (ermB, ermTR and mefA) in clinical isolates of Streptococcus agalactiae

RESUMEN El objetivo del estudio fue identificar molecularmente los genes de virulencia y resistencia a macrólidos en aislamientos clínicos de Streptococcus agalactiae (EGB), recuperados en 2019 a partir de secreción vaginal (n=9) y orina (n=22), en dos establecimientos de salud de Lima. La identificación y susceptibilidad antimicrobiana se determinaron por el sistema automatizado Vitek® 2, se confirmó la identificación fenotípicamente; la resistencia a macrólidos por el método D-test; la identificación de genes de virulencia (lmb, bca y rib) y de resistencia a macrólidos (ermB, ermTR y mefA) por reacción en cadena de la polimerasa (PCR). El fenotipo y genotipo de resistencia a macrólidos predominante fue cMLSb (12/31) y ermB (11/31), y el gen de virulencia más frecuente fue lmb (23/31). Todos fueron sensibles a penicilina, ampicilina y vancomicina. Estos hallazgos muestran la necesidad de implementar estudios de epidemiología molecular que permitan un adecuado conocimiento y seguimiento de EGB en el Perú.

ABSTRACT The aim of the study was to molecularly identify virulence and macrolide resistance genes in clinical isolates of Streptococcus agalactiae (GBS), recovered in 2019 from vaginal discharge (n=9) and urine (n=22), from two health facilities in Lima. Identification and antimicrobial susceptibility were determined by the Vitek® 2 automated system, identification was confirmed phenotypically; macrolide resistance was determined by the D-test method. Identification of virulence genes (lmb, bca and rib) and macrolide resistance genes (ermB, ermTR and mefA) was carried out by polymerase chain reaction (PCR). The predominant macrolide resistance phenotype and genotype were cMLSb (12/31) and ermB (11/31); the most frequent virulence gene was lmb (23/31). All were sensitive to penicillin, ampicillin and vancomycin. These findings show the need to implement molecular epidemiology studies that allow adequate knowledge and follow-up of GBS in Peru.

Comparison of Escherichia coli antibiotic-resistance profiles and incidence of betalactamase phenotypes in three private health facilities in Perú / [Comparación de los perfiles de resistencia antimicrobiana de Escherichia coli uropatógena e incidencia de la producción de betalactamasas de espectro extendido en tres establecimientos privados de salud de Perú].

Introduction: The appearance of multidrug-resistant and beta-lactamase producing enterobacteria in outpatient care facilities represent a public health problem in Perú. Objective: To compare the resistance profiles of uropathogenic Escherichia coli and to identify extended-spectrum beta-lactamase-producing phenotypes in three private health facilities located in the Peruvian coast, Andean and jungle regions. Materials and methods: We conducted a descriptive study on 98 urine samples from Lima (coast), Juliaca (Andean region) and Iquitos (jungle region) during 2016. We determined the antimicrobial susceptibility in 35 samples from Lima, 38 from Juliaca and 25 from Iquitos using eight antibiotic disks in samples from patients diagnosed with urinary infection. We also evaluated the production of extended-spectrum beta-lactamases with cefotaxime and ceftazidime disks and a combination of both with clavulanic acid on Mueller-Hinton agar. Results: We identified 18 resistance profiles ranging from those sensitive to others simultaneously resistant to seven antibiotics: 18.4% resistant to one and 54.0% to multiple antibiotics. We detected beta-lactamase production in 28.6% of the strains from the Puno region. Likewise, we observed a greater number of cases with resistance to ceftazidime, ceftriaxone, gentamicin, and trimethoprim-sulfamethoxazole in Puno's health facility in patients within the 31 to 45 year age range. Conclusion: Resistance profiles varied according to the geographical location of the health facilities under study. Resistance to antibiotics was higher in the Andean region with 28.6% of strains producing extended-spectrum beta-lactamases.

Introducción. La aparición de enterobacterias multirresistentes y productoras de betalactamasas de espectro extendido en pacientes ambulatorios con infecciones urinarias representa un problema de salud pública en Perú. Objetivo. Comparar los perfiles de resistencia de Escherichia coli uropatógenas e identificar los fenotipos de cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido en tres establecimientos privados de salud localizados en las regiones de la costa, la sierra y la selva de Perú. Materiales y métodos. Se llevó a cabo durante el 2016 un estudio descriptivo de 98 muestras de orina de pacientes con infección urinaria, 35 procedentes de Lima (costa), 38 de Juliaca (sierra) y 25 de Iquitos (selva), en el que se determinó la sensibilidad antimicrobiana utilizando ocho discos antibióticos. Asimismo, se evaluó la producción de betalactamasas de espectro extendido con discos de cefotaxima, de ceftazidima o de su combinación, con ácido clavulánico en agar Mueller-Hinton. Resultados. Se identificaron 18 perfiles de resistencia que incluían desde los sensibles a todos los antibióticos hasta los resistentes simultáneamente a siete antibióticos, con el 18,4 % de aislamientos resistentes a un antibiótico y el 54,0 % de multirresistentes. Se detectó producción de betalactamasas en el 28,6 % de las cepas procedentes de la región de Puno. También, se observó un mayor número de casos en el rango de edad de 31 a 45 años con resistencia a ceftazidima, ceftriaxona, gentamicina y trimetoprim-sulfametoxazol en el establecimiento de salud de Puno. Conclusión. Los perfiles de resistencia variaron según la localización geográfica del establecimiento de salud.

Comparación de los perfiles de resistencia antimicrobiana de Escherichia coli uropatógena e incidencia de la producción de betalactamasas de espectro extendido en tres establecimientos privados de salud de Perú / Comparison of Escherichia coli antibiotic-resistance profiles and incidence of beta- lactamase phenotypes in three private health facilities in Perú

Introducción. La aparición de enterobacterias multirresistentes y productoras de betalactamasas de espectro extendido en pacientes ambulatorios con infecciones urinarias representa un problema de salud pública en Perú. Objetivo. Comparar los perfiles de resistencia de Escherichia coli uropatógenas e identificar los fenotipos de cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido en tres establecimientos privados de salud localizados en las regiones de la costa, la sierra y la selva de Perú. Materiales y métodos. Se llevó a cabo durante el 2016 un estudio descriptivo de 98 muestras de orina de pacientes con infección urinaria, 35 procedentes de Lima (costa), 38 de Juliaca (sierra) y 25 de Iquitos (selva), en el que se determinó la sensibilidad antimicrobiana utilizando ocho discos antibióticos. Asimismo, se evaluó la producción de betalactamasas de espectro extendido con discos de cefotaxima, de ceftazidima o de su combinación, con ácido clavulánico en agar Mueller-Hinton. Resultados. Se identificaron 18 perfiles de resistencia que incluían desde los sensibles a todos los antibióticos hasta los resistentes simultáneamente a siete antibióticos, con el 18,4 % de aislamientos resistentes a un antibiótico y el 54,0 % de multirresistentes. Se detectó producción de betalactamasas en el 28,6 % de las cepas procedentes de la región de Puno. También, se observó un mayor número de casos en el rango de edad de 31 a 45 años con resistencia a ceftazidima, ceftriaxona, gentamicina y trimetoprim-sulfametoxazol en el establecimiento de salud de Puno. Conclusión. Los perfiles de resistencia variaron según la localización geográfica del establecimiento de salud, observándose mayor resistencia a los antibióticos en la región de la sierra de Perú, con el 28,6 % de cepas productoras de betalactamasas de espectro extendido.

Introduction: The appearance of multidrug-resistant and beta-lactamase producing enterobacteria in outpatient care facilities represent a public health problem in Perú. Objective: To compare the resistance profiles of uropathogenic Escherichia coli and to identify extended-spectrum beta-lactamase-producing phenotypes in three private health facilities located in the Peruvian coast, Andean and jungle regions. Materials and methods: We conducted a descriptive study on 98 urine samples from Lima (coast), Juliaca (Andean region) and Iquitos (jungle region) during 2016. We determined the antimicrobial susceptibility in 35 samples from Lima, 38 from Juliaca and 25 from Iquitos using eight antibiotic disks in samples from patients diagnosed with urinary infection. We also evaluated the production of extended-spectrum beta-lactamases with cefotaxime and ceftazidime disks and a combination of both with clavulanic acid on Mueller-Hinton agar. Results: We identified 18 resistance profiles ranging from those sensitive to others simultaneously resistant to seven antibiotics: 18.4% resistant to one and 54.0% to multiple antibiotics. We detected beta-lactamase production in 28.6% of the strains from the Puno region. Likewise, we observed a greater number of cases with resistance to ceftazidime, ceftriaxone, gentamicin, and trimethoprim-sulfamethoxazole in Puno's health facility in patients within the 31 to 45 year age range. Conclusion: Resistance profiles varied according to the geographical location of the health facilities under study. Resistance to antibiotics was higher in the Andean region with 28.6% of strains producing extended-spectrum beta-lactamases.

Surgical Site Infections Rates in More Than 13,000 Surgical Procedures in Three Cities in Peru: Findings of the International Nosocomial Infection Control Consortium.

BACKGROUND: Surgical site infections (SSIs) are a threat to patient safety. However, there are not available data on SSI rates stratified by surgical procedure (SP) in Peru. METHODS: From January 2005 to December 2010, a cohort prospective surveillance study on SSIs was conducted by the International Nosocomial Infection Control Consortium (INICC) in four hospitals in three cities of Peru. Data were recorded from hospitalized patients using the U.S. Centers for Disease Control and Prevention-National Healthcare Safety Network (CDC-NHSN) methods and definitions for SSI. Surgical procedures (SPs) were classified into 4 types, according to ICD-9 criteria. RESULTS: We recorded 352 SSIs, associated to 13,904 SPs (2.5%; CI, 2.3-2.8) SSI rates per type of SP were the following for this study's Peruvian hospitals, compared with rates of the INICC and CDC-NHSN reports, respectively: 2.9% for appendix surgery (vs. 2.9% vs. 1.4%); 2.8% for gallbladder surgery (vs. 2.5% vs. 0.6%); 2.2% for cesarean section (vs. 0.7% vs. 1.8%); 2.8% for vaginal hysterectomy (vs. 2.0% vs. 0.9%). CONCLUSIONS: Our SSIs rates were higher in all of the four analyzed types of SPs compared with CDC-NHSN, whereas compared with INICC, most rates were similar. This study represents an important advance in the knowledge of SSI epidemiology in Peru that will allow us to introduce targeted interventions.

[Metalo-ß-lactamases in clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa in Lima, Peru]. / Metalo-ß-lactamasas en aislamientos clínicos de Pseudomonas aeruginosa en Lima, Perú

The aim of this study was to detect and characterize molecularly metallo-ß-lactamase (MßL) in clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa. We carry out a cross sectional study in six publics hospital in Lima on August 2011. 51 isolates of P. aeruginosa resistant to ceftazidime and reduced susceptibility to carbapenemes were evaluated.The phenotypic assay was performed using the approximation method with substrate disks (ceftazidime, imipenem and meropenem) and ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA). MßL gene detection was performed using the technique of polymerase chain reaction (PCR) multiplex. Through MßL detected phenotypic method in 15.7% of isolates. Detection of genes revealed the presence of the gene in the 8 isolates blaIMP. The first report of MßL in P. aeruginosa in Peru was described, this should alert the monitoring equipment in the institutions to promote control their spread.

Metalo-ß-lactamasas en aislamientos clínicos de pseudomonas aeruginosa en Lima, Perú / Metalo-ß-lactamases in clinical isolates of pseudomonas aeruginosa in Lima, Peru

Con el objetivo de detectar y caracterizar molecularmente las metalo-ß-lactamasas (MßL) en aislamientos clínicos de Pseudomonas aeruginosa, se realizó un estudio trasversal en seis hospitales de referencia de Lima (Perú) en agosto de 2011. Se evaluó 51 aislamientos de P. aeruginosa, resistentes a ceftazidima y con sensibilidad reducida a carbapenémicos. El ensayo fenotípico se realizó con el método de aproximación de discos con sustratos (ceftazidima, imipenem y meropenem) y con ácido etilendiaminotetraacético (EDTA). La detección de genes MßL se realizó mediante la técnica de reacción en cadena de polimerasa multiplex. A través del método fenotípico se detectaron MßL en el 15,7% de los aislamientos, en todos ellos la detección de genes mostró la presencia del gen blaIMP. La descripción del primer reporte de MßL en aislamientos de P. aeruginosa en el Perú debería alertar a los equipos de vigilancia epidemiológica intrahospitalaria para promover su control y prevenir su diseminación.

The aim of this study was to detect and characterize molecularly metallo-ß-lactamase (MßL) in clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa. We carry out a cross sectional study in six publics hospital in Lima on August 2011. 51 isolates of P. aeruginosa resistant to ceftazidime and reduced susceptibility to carbapenemes were evaluated.The phenotypic assay was performed using the approximation method with substrate disks (ceftazidime, imipenem and meropenem) and ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA). MßL gene detection was performed using the technique of polymerase chain reaction (PCR) multiplex. Through MßL detected phenotypic method in 15.7% of isolates. Detection of genes revealed the presence of the gene in the 8 isolates blaIMP. The first report of MßL in P. aeruginosa in Peru was described, this should alert the monitoring equipment in the institutions to promote control their spread.

Flora bacteriana del tracto digestivo de caracoles Helix aspersa Müller bajo dos sistemas de crianza / Bacterial flora in the digestive tract of Helix aspersa Müller snails under two breeding systems

El objetivo del estudio fue comparar la flora bacteriana de intestino y hepatopáncreas del caracol Helix aspersa Müller criados en dos sistemas de producción: intensivo y extensivo. Se colectaron 30 caracoles adultos aparentemente sanos por cada sistema de producción, en seis criaderos ubicados en la provincia de Lima. Se tomó muestras de mucosa intestinal y parénquima del hepatopáncreas de cada individuo, empleando protocolos de aislamientos establecidos para bacterias aerobias y aerobias facultativas. Se aisló bacterias de 15 géneros: Escherichia, Citrobacter, Klebsiella, Enterobacter, Serratia, Hafnia, Proteus, Providencia, Aeromonas, Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus, Micrococcus, Pseudomonas, Acinetobacter; y bacilos gramnegativos no fermentadores (BNF). Se obtuvo 193 cepas en las muestras de caracoles del sistema extensivo, donde el género Escherichia fue el de mayor frecuencia (17.1%, 33/193); mientras que en caracoles del sistema intensivo se aisló 183 cepas, donde el género Klebsiella fue el de mayor frecuencia (17.5%, 32/183). Por otro lado, el género más frecuentemente aislado en intestino y hepatopáncreas fue Klebsiella (13.6%, 25/184 y 17.2%, 33/192, respectivamente). Bacterias de los géneros Providencia y Micrococcus solo se encontraron en el hepatopáncreas. Hubo diferencias estadísticas en la frecuencia de algunas bacterias aisladas dentro de cada tipo de muestra por efecto del sistema de crianza.

The objective of this study was to compare the bacterial flora present in the intestine and hepatopancreas of land snails (Helix aspersa Müller) under intensive and extensive breeding systems. Thirty healthy adult snails per production system were collected from six farms located in the province of Lima. Samples from intestinal mucosa and the hepatopancreas were examined from each animal using protocols of microbiological isolation established for aerobic and facultative aerobic bacteria. Bacteria of 15 genuses were isolated: Escherichia, Citrobacter, Klebsiella, Enterobacter, Serratia, Hafnia, Proteus, Providencia, Aeromonas, Staphylococcus, Streptococcus, Enterococcus, Micrococcus, Pseudomonas, Acinetobacter; and non-fermentative gram-negative bacillus (BNF). It was obtained 193 strains from samples of the extensive production system, where bacteria of the Escherichi genus were predominant (17.1%, 33/193); and 183 strains were isolated from samples in the intensive production system where the Klebsiella genus was the most frequent (17.5%, 32/183). Also, the Klebsiella was the most frequent isolated genus in both the intestine and the hepatopancreas (13.6%, 25/184, and 17.2%, 33/192 respectively). The Providencia and Micrococcus genuses were only isolated from the hepatopancreas. Statistical differences on the frequency of bacteria isolated between production systems were found.